Vizija Fakulteta znanosti o moru je usmjeravanje prema formiranju obrazovnog i znanstveno-istraživačkog centra izvrsnosti i prepoznatljivosti u istraživanju mora. Fakultet će uskladiti svoju nastavnu aktivnost sa znanstveno-istraživačkim i stručnim radom uz stalni prijenos znanja i rezultata istraživanja te suradnju s gospodarstvom u službi razvoja cijele regije. Fakultet će snažno poticati mobilnost svojih studenata i djelatnika radi osuvremenjivanja znanja i osiguravanja što kvalitetnijih znanstvenih i stručnih kadrova.
Ribarstvo i akvakultura
Održivo ribarstvo, procjena ribljih stokova i napredak u tehnologijama akvakulture te preradi proizvoda ribarstva.
Morska biotehnologija
Istraživanje morskih organizama radi pronalaska bioaktivnih spojeva i primjene inovativnih biotehnoloških postupaka u preradi hrane morskog podrijetla.
Morska ekologija i bioraznolikost
Raznolikost, rasprostranjenost i ponašanje morskih organizama, uključujući utjecaj promjena okoliša na morske ekosustave.
Oceanografija
Fizički procesi u Jadranskom moru i širem Sredozemlju, uključujući učinke klimatskih promjena.
Praćenje stanja mora i zaštita okoliša
Praćenje i ublažavanje onečišćenja mora (kakvoća mora za kupanje), zaštita ugroženih vrsta, upravljanje zaštićenim morskim područjima te istraživanje odnosa čovjeka i mora i izazova plave ekonomije.
Održivo ribarstvo, procjena ribljih stokova i napredak u tehnologijama akvakulture te preradi proizvoda ribarstva.
Morska biotehnologija
Istraživanje morskih organizama radi pronalaska bioaktivnih spojeva i primjene inovativnih biotehnoloških postupaka u preradi hrane morskog podrijetla.
Morska ekologija i bioraznolikost
Raznolikost, rasprostranjenost i ponašanje morskih organizama, uključujući utjecaj promjena okoliša na morske ekosustave.
Oceanografija
Fizički procesi u Jadranskom moru i širem Sredozemlju, uključujući učinke klimatskih promjena.
Praćenje stanja mora i zaštita okoliša
Praćenje i ublažavanje onečišćenja mora (kakvoća mora za kupanje), zaštita ugroženih vrsta, upravljanje zaštićenim morskim područjima te istraživanje odnosa čovjeka i mora i izazova plave ekonomije.